现在朱简焕之所以没有投降，原因就在于门头沟，所以只要拿下门头沟，一切问题都将迎刃而解。
九月初九，武狩帝发布檄文，让叛军士兵放下武器投降，此前不明所以而不小心支持太子的将领如果愿意投降，那也可以既往不咎，但朱简焕也同样发布檄文，继续散播武狩帝被吴王挟持的消息。
同一天，东海海军炮击天津港，秦国公李守弼率湖广、河南等上直六万兵马北伐。
西军都督岳濬率军进攻天竺四省，北军都督孙廷均领北军六万向山西、四川进攻。
南军都督罗辅与其子罗昀分别守卫天竺、长江、湘江防线，东军都督张炳忠率军防守漠北、陕西、北直隶防线。
同时，朱简焕命人不断在军备密库爆破墙体，试图从中取出大明历代先帝库存的先进武器。
诸藩眼看战事开打，印度厮当的秦、周、蜀、晋、赵等大藩纷纷上奏，请出兵策应北军与西军，但武狩帝担心诸藩会趁机在天竺四省培植自己的力量，因此不予批准。
九月初十，北军都督孙廷均率军入川，攻下剑门关，绵阳及成都、重庆一带的守军见状立即投降。
同时，由于西军都督岳濬之父为前任南军都督岳钟琪，因此天竺四省之兵大多不抵抗式投降，但很快被防守在西线的罗昀镇压。
九月十五，李守弼率装甲卡车突入门头沟，但被门头沟左右山上的炮群击退。
九月十七，东军都督张炳忠抽调东北兵马尽数入北直隶，李守弼被击退至保定。
海军由于没有足够的装甲卡车，因此无法向北京进攻。
九月二十五，齐王朱伯沐向西安发送电报，希望让齐国下场，及时收复门头沟，但武狩帝不允。
得知武狩帝不允齐国参战的消息，首辅李子任连番上疏请求武狩帝批准齐国出兵，吴王朱简炡亦上疏赞同。
然而遭遇长子背叛的武狩帝此刻已经听不进去任何劝告，执意要凭借大明自己的力量来平叛。
时间进入十月，双方各自的力量严重不足，大明尚可以以“平叛”的名义募兵，但叛军却已经开始靠高额军饷来进行征兵。
西军与北军在中原的装甲车、火炮严重不足，而上直又有三分之一参与反叛，因此战线一直僵持在居庸关、保定、天津、固安、太原一带。
除此之外，伴随着东军都督张炳忠率领大规模装甲卡车出现在河套平原，北军只能依托长城与陕北高原被动防守。
西南的岳濬虽然率军突入印度厮当，但南军副都督罗昀却与他在恒河交界处僵持，一时间难分胜负，双方都让认为自己是正义之师。
腊月，经过三个多月的扩军，明军扩军至九十二万，叛军扩军至八十三万，各地军械局之中的军械被双方挥霍殆尽，大明历代先帝积攒的数亿两积蓄也被挥霍大半。
武狩十二年正月初五，叛军打开军备院密库，大量未曾见过的军械和存放其中的资料及生产线被搬运出。
得知军备院密库被打开，武狩帝下令不惜一切代价夺回北京。
二月初五，明军北线战场发动“华北战役”，二十四万明军在秦国公李守弼的指挥下向北京进攻，叛军上直都督李黄来指挥十五万叛军防守。
起先明军数次向房山、固安、通州等地发起攻击，叛军节节败退，北京第一道防线被突破。
二月十二，朱简焕紧急调张炳忠及其麾下十二万叛军从河套回援北京。
二月十七日，明军夺回门头沟，然而里面的诸多学士及所有物资均被朱简焕运往沈阳军械局。