指挥的督标兵，这支军队的规模并不大，一般在两千人左右，直接听命总督指挥。
洪承畴在湖广本就有一支督标兵，但转任闽浙后，按照规矩原本的督标兵是不能带走上任的，这也是为了避免地方的封疆大吏以督标兵为基础私下打造家丁，拥兵自重从而最终实际转化成藩镇，掌控军权脱离朝廷控制的缘故。
按照朱慎锥最初对督标兵的设置，督标兵都是从其他地方调至总督衙门受总督指挥，总督虽拥有督标兵的管辖权限和指挥权，可实际上这支督标兵是由中枢派遣地方协助总督，而且这样的做法也避免了这支军队和地方势力产生瓜葛，再加上督标兵的兵员一般都有实际任期，通常三到四年就会更换一批，更确保了不会受到影响导致这支军队脱离中枢掌控。
就像现在一样，洪承畴去闽浙上任，中枢就会重新派一支督标兵给他，而现在朱慎锥调配给他的督标兵却和之前他的湖广的军队不一样。表面上看似乎没什么区别，可实际上这支军队是来自于大明最精锐的新军。足足两营的新军总计1920员军士，再加上各级指挥官和辅兵，全额超过了两千人，恰好是总督一个督标的数量。
这支督标兵的指挥官也是朱慎锥精挑细选出来的，不仅领军的是跟随朱慎锥靖难时的老人，拥有丰富的作战经验，从忠心程度上而言更毫无问题。
此外朱慎锥还在督标兵中增设了一个参军的文职，这个文职可以说是协助洪承畴指挥督标兵的助手，这个人选同样是朱慎锥特意选出来的，而这个人名不经传，外人很少听说过，但在后世却是大名鼎鼎。
此人姓阎名应元字丽亨，乃是京师通州人士。早些年，阎应元在江阴担任典史，典史这个官算是芝麻绿豆官儿，仅仅只是从九品而已，从官职来说刚刚脱离吏的阶层，进入到官员的级别。
按照后世的官职划分，所谓的典史就是县公安局局长，为知县下掌管缉捕、监狱的属官。阎应元在江阴当典史的时候海寇顾三麻子率数百艘战船进犯黄田港，阎应元领兵据守，连发三箭，皆有人应弦而倒。
海寇心惊胆战，不敢再犯。他任内平定盐盗，平服民乱，政绩突出，江阴百姓感激他的恩德，在社学中为他画像留念。
虽然他的官职不高，但在任期间官声极好，之后朝廷打算调任他去广东担任主簿，从官品来说算是高升了。可当时阎应元的母亲重病，未能成行，之后因为朱慎锥打着清君侧、靖国难的旗号进了京师，从而大明变了天，刚刚回到京师的阎应元就此留在京师没去上任，在家服侍其母，后母病故后，他又搬出城外结庐守孝，一守就是三年的光阴。
三年后，阎应元回到京师，由于他的官职依旧在身，自然是需要去吏部报道的。可因为之前的缘故，他原本主簿的官职早就有人接替了，所以吏部只能让他在京等候安置。
就在这个时候，张锡钧受命前往江南巡抚，出京时从户部要了些人随同去江南，而因为阎应元在江阴的经历和原本的官职，户部就把他调到了张锡钧的手下当了个巡抚下属的主簿。
因为阎应元不仅在江阴当过官，还做过典史，对于刑名一事很是精通，而且此人做事认真，颇有才干，胆大心细，能力出众。在张锡钧的手下阎应元很快就脱颖而出，在江南案中阎应元作为张锡钧手下的主簿不仅做好了本职工作，还以他出色能力协助张锡钧在进行调查案件，缉拿罪官的过程中发挥出了重大作用。
就此在之后的论功行赏中，张锡钧特意把阎应元的名字放在了前列，这才让朱慎锥注意到了这个人。别人不知道阎应元，但朱慎锥对阎应元这个名字极为熟悉，要知道这人在后世可是名人，更有着抗清三公之一的美称，就这样阎应元的大名就入了朱慎锥的眼。
在确定了这个阎应元的确是记忆中的那人后，朱慎锥顿时起了爱才之心，不仅升了阎应元的官，还把他从南京调回京师任职。
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