在一起了才出名的，他一出道就是天才漫画家啊。”
“就是就是！”
……
而在陆源堂入赘碇家，成为碇唯的丈夫之后不久。
美里的父亲葛博士提出了S2理论，即“超级螺线管理论”。
理论基础是DNA这样的螺旋形状可以提供无尽的能量。
这个“S2”的名字一出，一下子就让人想到了前两集，律子和Seele都提到过的S2机关。
之前第十四天使袭击事件中，初号机暴走直接吞噬了力天使的S2机关。
难道说的就是这个？
因为使徒拥有了S2机关，才会有源源不断的能量支持其庞大的身体行动。
那按照这个理论，初号机有了S2机关，岂不是也是这样，自己就能拥有力量？
然后葛博士的团体选择前往南极大陆验证S2理论，着手研究S2机关的研发。
从死海发现的朗基努斯之枪也被带到了南极基地，然后……他们开始对“亚当”进行了调查，并着手和“亚当”的接触实验。
而这次接触实验，造成的就是第二次冲击事件。
这个时候，随行的碇源堂和后面说到的基尔议长却是率先一步带着这次的实验数据回到了NERV总部。
显然他们知道会接下来发生什么事情。
葛博士的团队果然在接下来的和“亚当”的接触实验当中，引发了名为第二次冲击的惨案。
他们尝试用朗基努斯之枪封印住“亚当”，但是失败了。
第二次冲击的惨案发生，南极大陆化为空洞，幸运生还的年幼美里也出现在了画面之中。
她生还后还患上了失语症，很长时间才从中走出来
从此南极大陆变成控工，海平面上升数十米，就连地球的自转轴也出现偏离，灾害不断。
地球发生剧变，然而在其描述中，被高层们掩盖了下来，将其描述为一场陨石撞击的天灾，而非人祸。
而在Seele组织高层中，死海文书的内容再次得到了验证。
接着在他们的授意下，E计划启动，即复兴亚当计划。
然后他们又在死海文书内容的提示下，他们在如今新魔都市的地方发现了另外一个巨大地洞。
而Gehirn研究所就在这里建立了起来。
在这之后，E计划的进程加快，他们建造出了EVA初号机的头颅和脊髓。
冬月博士便因此被碇源堂所蛊惑，加入到了制作EVA机体的项目之中。
而就在E计划进行中，名为慕赤子的女人出现，她是超级计算机科学家，而她就是律子的母亲。
她被碇源堂重用，着力研发出了后面成为NERV总部独立系统的MAGI计算机系统。
然后……
初号机也开始着手建造，但就在这个时候，碇唯带到了此时还只是小孩子的碇真嗣来到初号机的研发基地。
然后……她就这样失踪了。
剧集里没说为什么，总之她就意外失踪了，给碇真嗣造成很大心理阴影。
他直接就此离开了新魔都市。
但碇源堂的脚步却未就此停止，零号机和初号机的研发还在继续，他还提出了一个全新的计划。
虽然他没有明说计划是什么，但是大家很清楚……
这大概就是那个被反复提及的“人类补完计划”。
接着，年幼时期的绫波丽就这样水灵灵地突然出现在了碇源堂身边。
只不过这个绫波-->>